Python sites.Site类代码示例

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本文整理汇总了Python中pymatgen.core.sites.Site类的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Site类的具体用法？Python Site怎么用？Python Site使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的类代码示例或许可以为您提供帮助。

在下文中一共展示了Site类的9个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于我们的系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: setUp

 def setUp(self):
     self.ordered_site = Site("Fe", [0.25, 0.35, 0.45])
     self.disordered_site = Site({"Fe": 0.5, "Mn": 0.5},
                                 [0.25, 0.35, 0.45])
     self.propertied_site = Site("Fe2+", [0.25, 0.35, 0.45],
                                 {'magmom': 5.1, 'charge': 4.2})
     self.dummy_site = Site("X", [0, 0, 0])

开发者ID:albalu，项目名称:pymatgen，代码行数:7，代码来源:test_sites.py

示例2: SiteTest

class SiteTest(PymatgenTest):

    def setUp(self):
        self.ordered_site = Site("Fe", [0.25, 0.35, 0.45])
        self.disordered_site = Site({"Fe": 0.5, "Mn": 0.5},
                                    [0.25, 0.35, 0.45])
        self.propertied_site = Site("Fe2+", [0.25, 0.35, 0.45],
                                    {'magmom': 5.1, 'charge': 4.2})
        self.dummy_site = Site("X", [0, 0, 0])

    def test_properties(self):
        self.assertRaises(AttributeError, getattr, self.disordered_site,
                          'specie')
        self.assertIsInstance(self.ordered_site.specie, Element)
        self.assertEqual(self.propertied_site.properties["magmom"], 5.1)
        self.assertEqual(self.propertied_site.properties["charge"], 4.2)

    def test_to_from_dict(self):
        d = self.disordered_site.as_dict()
        site = Site.from_dict(d)
        self.assertEqual(site, self.disordered_site)
        self.assertNotEqual(site, self.ordered_site)
        d = self.propertied_site.as_dict()
        site = Site.from_dict(d)
        self.assertEqual(site.properties["magmom"], 5.1)
        self.assertEqual(site.properties["charge"], 4.2)
        d = self.dummy_site.as_dict()
        site = Site.from_dict(d)
        self.assertEqual(site.species, self.dummy_site.species)

    def test_hash(self):
        self.assertEqual(self.ordered_site.__hash__(), 26)
        self.assertEqual(self.disordered_site.__hash__(), 51)

    def test_cmp(self):
        self.assertTrue(self.ordered_site > self.disordered_site)

    def test_distance(self):
        osite = self.ordered_site
        self.assertAlmostEqual(np.linalg.norm([0.25, 0.35, 0.45]),
                               osite.distance_from_point([0, 0, 0]))
        self.assertAlmostEqual(osite.distance(self.disordered_site), 0)

    def test_pickle(self):
        o = pickle.dumps(self.propertied_site)
        self.assertEqual(pickle.loads(o), self.propertied_site)

    def test_setters(self):
        self.disordered_site.species = "Cu"
        self.assertEqual(self.disordered_site.species, Composition("Cu"))
        self.disordered_site.x = 1.25
        self.disordered_site.y = 1.35
        self.assertEqual(self.disordered_site.coords[0], 1.25)
        self.assertEqual(self.disordered_site.coords[1], 1.35)

        def set_bad_species():
            self.disordered_site.species = {"Cu": 0.5, "Gd": 0.6}
        self.assertRaises(ValueError, set_bad_species)

开发者ID:adengz，项目名称:pymatgen，代码行数:58，代码来源:test_sites.py

示例3: test_to_from_dict

 def test_to_from_dict(self):
     d = self.disordered_site.to_dict
     site = Site.from_dict(d)
     self.assertEqual(site, self.disordered_site)
     self.assertNotEqual(site, self.ordered_site)
     d = self.propertied_site.to_dict
     site = Site.from_dict(d)
     self.assertEqual(site.magmom, 5.1)
     self.assertEqual(site.charge, 4.2)

开发者ID:jesuansito，项目名称:pymatgen，代码行数:9，代码来源:test_sites.py

示例4: test_to_from_dict

 def test_to_from_dict(self):
     d = self.disordered_site.as_dict()
     site = Site.from_dict(d)
     self.assertEqual(site, self.disordered_site)
     self.assertNotEqual(site, self.ordered_site)
     d = self.propertied_site.as_dict()
     site = Site.from_dict(d)
     self.assertEqual(site.magmom, 5.1)
     self.assertEqual(site.charge, 4.2)
     d = self.dummy_site.as_dict()
     site = Site.from_dict(d)
     self.assertEqual(site.species_and_occu, self.dummy_site.species_and_occu)

开发者ID:albalu，项目名称:pymatgen，代码行数:12，代码来源:test_sites.py

示例5: test_to_from_dict

 def test_to_from_dict(self):
     d = self.disordered_site.as_dict()
     site = Site.from_dict(d)
     self.assertEqual(site, self.disordered_site)
     self.assertNotEqual(site, self.ordered_site)
     d = self.propertied_site.as_dict()
     site = Site.from_dict(d)
     self.assertEqual(site.properties["magmom"], 5.1)
     self.assertEqual(site.properties["charge"], 4.2)
     d = self.dummy_site.as_dict()
     site = Site.from_dict(d)
     self.assertEqual(site.species, self.dummy_site.species)

开发者ID:adengz，项目名称:pymatgen，代码行数:12，代码来源:test_sites.py

示例6: SiteTest

class SiteTest(PymatgenTest):

    def setUp(self):
        self.ordered_site = Site("Fe", [0.25, 0.35, 0.45])
        self.disordered_site = Site({"Fe": 0.5, "Mn": 0.5},
                                    [0.25, 0.35, 0.45])
        self.propertied_site = Site("Fe2+", [0.25, 0.35, 0.45],
                                    {'magmom': 5.1, 'charge': 4.2})
        self.dummy_site = Site("X", [0, 0, 0])

    def test_properties(self):
        self.assertRaises(AttributeError, getattr, self.disordered_site,
                          'specie')
        self.assertIsInstance(self.ordered_site.specie, Element)
        self.assertEqual(self.propertied_site.magmom, 5.1)
        self.assertEqual(self.propertied_site.charge, 4.2)

    def test_to_from_dict(self):
        d = self.disordered_site.as_dict()
        site = Site.from_dict(d)
        self.assertEqual(site, self.disordered_site)
        self.assertNotEqual(site, self.ordered_site)
        d = self.propertied_site.as_dict()
        site = Site.from_dict(d)
        self.assertEqual(site.magmom, 5.1)
        self.assertEqual(site.charge, 4.2)
        d = self.dummy_site.as_dict()
        site = Site.from_dict(d)
        self.assertEqual(site.species_and_occu, self.dummy_site.species_and_occu)

    def test_hash(self):
        self.assertEqual(self.ordered_site.__hash__(), 26)
        self.assertEqual(self.disordered_site.__hash__(), 51)

    def test_cmp(self):
        self.assertTrue(self.ordered_site > self.disordered_site)

    def test_distance(self):
        osite = self.ordered_site
        self.assertAlmostEqual(np.linalg.norm([0.25, 0.35, 0.45]),
                               osite.distance_from_point([0, 0, 0]))
        self.assertAlmostEqual(osite.distance(self.disordered_site), 0)

    def test_pickle(self):
        o = pickle.dumps(self.propertied_site)
        self.assertEqual(pickle.loads(o), self.propertied_site)

开发者ID:albalu，项目名称:pymatgen，代码行数:46，代码来源:test_sites.py

示例7: SiteTest

class SiteTest(unittest.TestCase):

    def setUp(self):
        self.ordered_site = Site(Element("Fe"), [0.25, 0.35, 0.45])
        self.disordered_site = Site({Element("Fe"): 0.5, Element("Mn"): 0.5},
                                    [0.25, 0.35, 0.45])
        self.propertied_site = Site(Specie("Fe", 2), [0.25, 0.35, 0.45],
                                    {'magmom': 5.1, 'charge': 4.2})

    def test_init(self):
        self.assertRaises(ValueError, Site, Specie("Fe", 2),
                          [0.25, 0.35, 0.45], {'mag': 5.1})

    def test_properties(self):
        self.assertRaises(AttributeError, getattr, self.disordered_site,
                          'specie')
        self.assertIsInstance(self.ordered_site.specie, Element)
        self.assertEqual(self.propertied_site.magmom, 5.1)
        self.assertEqual(self.propertied_site.charge, 4.2)

    def test_to_from_dict(self):
        d = self.disordered_site.to_dict
        site = Site.from_dict(d)
        self.assertEqual(site, self.disordered_site)
        self.assertNotEqual(site, self.ordered_site)
        d = self.propertied_site.to_dict
        site = Site.from_dict(d)
        self.assertEqual(site.magmom, 5.1)
        self.assertEqual(site.charge, 4.2)

    def test_hash(self):
        self.assertEqual(self.ordered_site.__hash__(), 26)
        self.assertEqual(self.disordered_site.__hash__(), 25.5)

    def test_cmp(self):
        self.assertTrue(self.ordered_site > self.disordered_site)

    def test_distance(self):
        osite = self.ordered_site
        self.assertAlmostEqual(np.linalg.norm([0.25, 0.35, 0.45]),
                               osite.distance_from_point([0, 0, 0]))
        self.assertAlmostEqual(osite.distance(self.disordered_site), 0)

    def test_pickle(self):
        o = pickle.dumps(self.propertied_site)
        self.assertEqual(pickle.loads(o), self.propertied_site)

开发者ID:jesuansito，项目名称:pymatgen，代码行数:46，代码来源:test_sites.py

示例8: setUp

 def setUp(self):
     self.ordered_site = Site(Element("Fe"), [0.25, 0.35, 0.45])
     self.disordered_site = Site({Element("Fe"): 0.5, Element("Mn"): 0.5},
                                 [0.25, 0.35, 0.45])
     self.propertied_site = Site(Specie("Fe", 2), [0.25, 0.35, 0.45],
                                 {'magmom': 5.1, 'charge': 4.2})

开发者ID:jesuansito，项目名称:pymatgen，代码行数:6，代码来源:test_sites.py

示例9: setUp

 def setUp(self):
     self.ordered_site = Site("Fe", [0.25, 0.35, 0.45])
     self.disordered_site = Site({"Fe": 0.5, "Mn": 0.5}, [0.25, 0.35, 0.45])
     self.propertied_site = Site("Fe2+", [0.25, 0.35, 0.45], {"magmom": 5.1, "charge": 4.2})

开发者ID:navnidhirajput，项目名称:pymatgen，代码行数:4，代码来源:test_sites.py

注：本文中的pymatgen.core.sites.Site类示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等源码及文档管理平台，相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目，源码版权归原作者所有，传播和使用请参考对应项目的License；未经允许，请勿转载。

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