设置Spark在本机设置和运行Spark非常简单。你只需要下载一个预构建的包，只要你安装了Java 6+和Python 2.6+，就可以在Windows、Mac OS X和Linux上运行Spark。确保java程序在PATH环境变量中，或者设置了JAVA_HOME环境变量。类似的，python也要在PATH中。 假设你已经安装了Java和Python： - 访问Spark下载页
- 选择Spark最新发布版(本文写作时是1.2.0)，一个预构建的Hadoop 2.4包，直接下载。
现在，如何继续依赖于你的操作系统，靠你自己去探索了。Windows用户可以在评论区对如何设置的提示进行评论。 一般，我的建议是按照下面的步骤(在POSIX操作系统上)： 1.解压Spark ~$ tar -xzf spark-1.2.0-bin-hadoop2.4.tgz
2.将解压目录移动到有效应用程序目录中(如Windows上的 ~$ mv spark-1.2.0-bin-hadoop2.4 /srv/spark-1.2.0
3.创建指向该Spark版本的符号链接到<spark目录。这样你可以简单地下载新/旧版本的Spark，然后修改链接来管理Spark版本，而不用更改路径或环境变量。 ~$ ln -s /srv/spark-1.2.0 /srv/spark
4.修改BASH配置，将Spark添加到PATH中，设置SPARK_HOME环境变量。这些小技巧在命令行上会帮到你。在Ubuntu上，只要编辑~/.bash_profile或~/.profile文件，将以下语句添加到文件中： export SPARK_HOME=/srv/spark
export PATH=$SPARK_HOME/bin:$PATH
5.source这些配置（或者重启终端）之后，你就可以在本地运行一个pyspark解释器。执行pyspark命令，你会看到以下结果： ~$ pyspark
Python 2.7.8 (default, Dec 2 2014, 12:45:58)
[GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 6.0 (clang-600.0.54)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
Spark assembly has been built with Hive, including Datanucleus jars on classpath
Using Sparks default log4j profile: org/apache/spark/log4j-defaults.properties
[… snip …]
Welcome to
____ __
/ __/__ ___ _____/ /__
_\ \/ _ \/ _ `/ __/ `_/
/__ / .__/\_,_/_/ /_/\_\ version 1.2.0
/_/
Using Python version 2.7.8 (default, Dec 2 2014 12:45:58)
SparkContext available as sc.
>>>
现在Spark已经安装完毕，可以在本机以”单机模式“（standalone mode）使用。你可以在本机开发应用并提交Spark作业，这些作业将以多进程/多线程模式运行的，或者，配置该机器作为一个集群的客户端（不推荐这样做，因为在Spark作业中，驱动程序(driver)是个很重要的角色，并且应该与集群的其他部分处于相同网络）。可能除了开发，你在本机使用Spark做得最多的就是利用spark-ec2脚本来配置Amazon云上的一个EC2 Spark集群了。 简略Spark输出 Spark（和PySpark）的执行可以特别详细，很多INFO日志消息都会打印到屏幕。开发过程中，这些非常恼人，因为可能丢失Python栈跟踪或者print的输出。为了减少Spark输出 – 你可以设置$SPARK_HOME/conf下的log4j。首先，拷贝一份$SPARK_HOME/conf/log4j.properties.template文件，去掉“.template”扩展名。 ~$ cp $SPARK_HOME/conf/log4j.properties.template $SPARK_HOME/conf/log4j.properties
编辑新文件，用WARN替换代码中出现的INFO。你的log4j.properties文件类似： # Set everything to be logged to the console
log4j.rootCategory=WARN, console
log4j.appender.console=org.apache.log4j.ConsoleAppender
log4j.appender.console.target=System.err
log4j.appender.console.layout=org.apache.log4j.PatternLayout
log4j.appender.console.layout.ConversionPattern=%d{yy/MM/dd HH:mm:ss} %p %c{1}: %m%n
# Settings to quiet third party logs that are too verbose
log4j.logger.org.eclipse.jetty=WARN
log4j.logger.org.eclipse.jetty.util.component.AbstractLifeCycle=ERROR
log4j.logger.org.apache.spark.repl.SparkIMain$exprTyper=WARN
log4j.logger.org.apache.spark.repl.SparkILoop$SparkILoopInterpreter=WARN
现在运行PySpark，输出消息将会更简略！感谢@genomegeek在一次District Data Labs的研讨会中指出这一点。 在Spark中使用IPython Notebook当搜索有用的Spark小技巧时，我发现了一些文章提到在PySpark中配置IPython notebook。IPython notebook对数据科学家来说是个交互地呈现科学和理论工作的必备工具，它集成了文本和Python代码。对很多数据科学家，IPython notebook是他们的Python入门，并且使用非常广泛，所以我想值得在本文中提及。 这里的大部分说明都来改编自IPython notebook: 在PySpark中设置IPython。但是，我们将聚焦在本机以单机模式将IPtyon shell连接到PySpark，而不是在EC2集群。如果你想在一个集群上使用PySpark/IPython，查看并评论下文的说明吧！ - 1.为Spark创建一个iPython notebook配置
~$ ipython profile create spark
[ProfileCreate] Generating default config file: u'$HOME/.ipython/profile_spark/ipython_config.py'
[ProfileCreate] Generating default config file: u'$HOME/.ipython/profile_spark/ipython_notebook_config.py'
[ProfileCreate] Generating default config file: u'$HOME/.ipython/profile_spark/ipython_nbconvert_config.py'
记住配置文件的位置，替换下文各步骤相应的路径： 2.创建文件$HOME/.ipython/profile_spark/startup/00-pyspark-setup.py，并添加如下代码： import os
import sys
# Configure the environment
if 'SPARK_HOME' not in os.environ:
os.environ['SPARK_HOME'] = '/srv/spark'
# Create a variable for our root path
SPARK_HOME = os.environ['SPARK_HOME']
# Add the PySpark/py4j to the Python Path
sys.path.insert(0, os.path.join(SPARK_HOME, "python", "build"))
sys.path.insert(0, os.path.join(SPARK_HOME, "python"))
3.使用我们刚刚创建的配置来启动IPython notebook。 ~$ ipython notebook --profile spark
4.在notebook中，你应该能看到我们刚刚创建的变量。 5.在IPython notebook最上面，确保你添加了Spark context。 from pyspark import SparkContext
sc = SparkContext( 'local', 'pyspark')
6.使用IPython做个简单的计算来测试Spark context。 def isprime(n):
"""
check if integer n is a prime
"""
# make sure n is a positive integer
n = abs(int(n))
# 0 and 1 are not primes
if n < 2:
return False
# 2 is the only even prime number
if n == 2:
return True
# all other even numbers are not primes
if not n & 1:
return False
# range starts with 3 and only needs to go up the square root of n
# for all odd numbers
for x in range(3, int(n**0.5)+1, 2):
if n % x == 0:
return False
return True
# Create an RDD of numbers from 0 to 1,000,000
nums = sc.parallelize(xrange(1000000))
# Compute the number of primes in the RDD
print nums.filter(isprime).count()
编辑提示：上面配置了一个使用PySpark直接调用IPython notebook的IPython context。但是，你也可以使用PySpark按以下方式直接启动一个notebook： $ IPYTHON_OPTS=”notebook –pylab inline” pyspark 哪个方法好用取决于你使用PySpark和IPython的具体情景。前一个允许你更容易地使用IPython notebook连接到一个集群，因此是我喜欢的方法。 在EC2上使用Spark在讲授使用Hadoop进行分布式计算时，我发现很多可以通过在本地伪分布式节点（pseudo-distributed node）或以单节点模式（single-node mode）讲授。但是为了了解真正发生了什么，就需要一个集群。当数据变得庞大，这些书面讲授的技能和真实计算需求间经常出现隔膜。如果你肯在学习详细使用Spark上花钱，我建议你设置一个快速Spark集群做做实验。 包含5个slave（和1个master）每周大概使用10小时的集群每月大概需要$45.18。 完整的讨论可以在Spark文档中找到：在EC2上运行Spark在你决定购买EC2集群前一定要通读这篇文档！我列出了一些关键点： - 通过AWS Console获取AWS EC2 key对（访问key和密钥key）。
- 将key对导出到你的环境中。在shell中敲出以下命令，或者将它们添加到配置中。
export AWS_ACCESS_KEY_ID=myaccesskeyid
export AWS_SECRET_ACCESS_KEY=mysecretaccesskey
注意不同的工具使用不同的环境名称，确保你用的是Spark脚本所使用的名称。 3.启动集群： ~$ cd $SPARK_HOME/ec2
ec2$ ./spark-ec2 -k <keypair> -i <key-file> -s <num-slaves> launch <cluster-name>
4.SSH到集群来运行Spark作业。 ec2$ ./spark-ec2 -k <keypair> -i <key-file> login <cluster-name>
5.销毁集群 ec2$ ./spark-ec2 destroy <cluster-name>.
这些脚本会自动创建一个本地的HDFS集群来添加数据，copy-dir命令可以同步代码和数据到该集群。但是你最好使用S3来存储数据，创建使用s3://URI来加载数据的RDDs。 Spark是什么？既然设置好了Spark，现在我们讨论下Spark是什么。Spark是个通用的集群计算框架，通过将大量数据集计算任务分配到多台计算机上，提供高效内存计算。如果你熟悉Hadoop，那么你知道分布式计算框架要解决两个问题：如何分发数据和如何分发计算。Hadoop使用HDFS来解决分布式数据问题，MapReduce计算范式提供有效的分布式计算。类似的，Spark拥有多种语言的函数式编程API，提供了除map和reduce之外更多的运算符，这些操作是通过一个称作弹性分布式数据集(resilient distributed datasets, RDDs)的分布式数据框架进行的。 本质上，RDD是种编程抽象，代表可以跨机器进行分割的只读对象集合。RDD可以从一个继承结构（lineage）重建（因此可以容错），通过并行操作访问，可以读写HDFS或S3这样的分布式存储，更重要的是，可以缓存到worker节点的内存中进行立即重用。由于RDD可以被缓存在内存中，Spark对迭代应用特别有效，因为这些应用中，数据是在整个算法运算过程中都可以被重用。大多数机器学习和最优化算法都是迭代的，使得Spark对数据科学来说是个非常有效的工具。另外，由于Spark非常快，可以通过类似Python REPL的命令行提示符交互式访问。 Spark库本身包含很多应用元素，这些元素可以用到大部分大数据应用中，其中包括对大数据进行类似SQL查询的支持，机器学习和图算法，甚至对实时流数据的支持。 核心组件如下： - Spark Core：包含Spark的基本功能；尤其是定义RDD的API、操作以及这两者上的动作。其他Spark的库都是构建在RDD和Spark Core之上的。
- Spark SQL：提供通过Apache Hive的SQL变体Hive查询语言（HiveQL）与Spark进行交互的API。每个数据库表被当做一个RDD，Spark SQL查询被转换为Spark操作。对熟悉Hive和HiveQL的人，Spark可以拿来就用。
- Spark Streaming：允许对实时数据流进行处理和控制。很多实时数据库（如Apache Store）可以处理实时数据。Spark Streaming允许程序能够像普通RDD一样处理实时数据。
- MLlib：一个常用机器学习算法库，算法被实现为对RDD的Spark操作。这个库包含可扩展的学习算法，比如分类、回归等需要对大量数据集进行迭代的操作。之前可选的大数据机器学习库Mahout，将会转到Spark，并在未来实现。
- GraphX：控制图、并行图操作和计算的一组算法和工具的集合。GraphX扩展了RDD API，包含控制图、创建子图、访问路径上所有顶点的操作。
由于这些组件满足了很多大数据需求，也满足了很多数据科学任务的算法和计算上的需要，Spark快速流行起来。不仅如此，Spark也提供了使用Scala、Java和Python编写的API；满足了不同团体的需求，允许更多数据科学家简便地采用Spark作为他们的大数据解决方案。 对Spark编程编写Spark应用与之前实现在Hadoop上的其他数据流语言类似。代码写入一个惰性求值的驱动程序（driver program）中，通过一个动作（action），驱动代码被分发到集群上，由各个RDD分区上的worker来执行。然后结果会被发送回驱动程序进行聚合或编译。本质上，驱动程序创建一个或多个RDD，调用操作来转换RDD，然后调用动作处理被转换后的RDD。 这些步骤大体如下： - 定义一个或多个RDD，可以通过获取存储在磁盘上的数据（HDFS，Cassandra，HBase，Local Disk），并行化内存中的某些集合，转换（transform）一个已存在的RDD，或者，缓存或保存。
- 通过传递一个闭包（函数）给RDD上的每个元素来调用RDD上的操作。Spark提供了除了Map和Reduce的80多种高级操作。
- 使用结果RDD的动作（action）（如count、collect、save等）。动作将会启动集群上的计算。
当Spark在一个worker上运行闭包时，闭包中用到的所有变量都会被拷贝到节点上，但是由闭包的局部作用域来维护。Spark提供了两种类型的共享变量，这些变量可以按照限定的方式被所有worker访问。广播变量会被分发给所有worker，但是是只读的。累加器这种变量，worker可以使用关联操作来“加”，通常用作计数器。 Spark应用本质上通过转换和动作来控制RDD。后续文章将会深入讨论，但是理解了这个就足以执行下面的例子了。 Spark的执行简略描述下Spark的执行。本质上，Spark应用作为独立的进程运行，由驱动程序中的SparkContext协调。这个context将会连接到一些集群管理者（如YARN），这些管理者分配系统资源。集群上的每个worker由执行者（executor）管理，执行者反过来由SparkContext管理。执行者管理计算、存储，还有每台机器上的缓存。 重点要记住的是应用代码由驱动程序发送给执行者，执行者指定context和要运行的任务。执行者与驱动程序通信进行数据分享或者交互。驱动程序是Spark作业的主要参与者，因此需要与集群处于相同的网络。这与Hadoop代码不同，Hadoop中你可以在任意位置提交作业给JobTracker，JobTracker处理集群上的执行。 与Spark交互 使用Spark最简单的方式就是使用交互式命令行提示符。打开PySpark终端，在命令行中打出pyspark。 ~$ pyspark
[… snip …]
>>>
PySpark将会自动使用本地Spark配置创建一个SparkContext。你可以通过sc变量来访问它。我们来创建第一个RDD。 >>> text = sc.textFile("shakespeare.txt")
>>> print text
shakespeare.txt MappedRDD[1] at textFile at NativeMethodAccessorImpl.java:-2
textFile方法将莎士比亚全部作品加载到一个RDD命名文本。如果查看了RDD，你就可以看出它是个MappedRDD，文件路径是相对于当前工作目录的一个相对路径（记得传递磁盘上正确的shakespear.txt文件路径）。我们转换下这个RDD，来进行分布式计算的“hello world”：“字数统计”。 >>> from operator import add
>>> def tokenize(text):
... return text.split()
...
>>> words = text.flatMap(tokenize)
>>> print words
PythonRDD[2] at RDD at PythonRDD.scala:43
我们首先导入了add操作符，它是个命名函数，可以作为加法的闭包来使用。我们稍后再使用这个函数。首先我们要做的是把文本拆分为单词。我们创建了一个tokenize函数，参数是文本片段，返回根据空格拆分的单词列表。然后我们通过给flatMap操作符传递tokenize闭包对textRDD进行变换创建了一个wordsRDD。你会发现，words是个PythonRDD，但是执行本应该立即进行。显然，我们还没有把整个莎士比亚数据集拆分为单词列表。 如果你曾使用MapReduce做过Hadoop版的“字数统计”，你应该知道下一步是将每个单词映射到一个键值对，其中键是单词，值是1，然后使用reducer计算每个键的1总数。 首先，我们map一下。 >>> wc = words.map(lambda x: (x,1))
>>> print wc.toDebugString()
(2) PythonRDD[3] at RDD at PythonRDD.scala:43
| shakespeare.txt MappedRDD[1] at textFile at NativeMethodAccessorImpl.java:-2
| shakespeare.txt HadoopRDD[0] at textFile at NativeMethodAccessorImpl.java:-2
我使用了一个匿名函数（用了Python中的lambda关键字）而不是命名函数。这行代码将会把lambda映射到每个单词。因此，每个x都是一个单词，每个单词都会被匿名闭包转换为元组(word, 1)。为了查看转换关系，我们使用toDebugString方法来查看PipelinedRDD是怎么被转换的。可以使用reduceByKey动作进行字数统计，然后把统计结果写到磁盘。 >>> counts = wc.reduceByKey(add)
>>> counts.saveAsTextFile("wc")
一旦我们最终调用了saveAsTextFile动作，这个分布式作业就开始执行了，在作业“跨集群地”（或者你本机的很多进程）运行时，你应该可以看到很多INFO语句。如果退出解释器，你可以看到当前工作目录下有个“wc”目录。 $ ls wc/
_SUCCESS part-00000 part-00001
每个part文件都代表你本机上的进程计算得到的被保持到磁盘上的最终RDD。如果对一个part文件进行head命令，你应该能看到字数统计元组。 $ head wc/part-00000
(u'fawn', 14)
(u'Fame.', 1)
(u'Fame,', 2)
(u'kinghenryviii@7731', 1)
(u'othello@36737', 1)
(u'loveslabourslost@51678', 1)
(u'1kinghenryiv@54228', 1)
(u'troilusandcressida@83747', 1)
(u'fleeces', 1)
(u'midsummersnightsdream@71681', 1)
注意这些键没有像Hadoop一样被排序（因为Hadoop中Map和Reduce任务中有个必要的打乱和排序阶段）。但是，能保证每个单词在所有文件中只出现一次，因为你使用了reduceByKey操作符。你还可以使用sort操作符确保在写入到磁盘之前所有的键都被排过序。 编写一个Spark应用编写Spark应用与通过交互式控制台使用Spark类似。API是相同的。首先，你需要访问<SparkContext，它已经由<pyspark自动加载好了。 使用Spark编写Spark应用的一个基本模板如下： ## Spark Application - execute with spark-submit
## Imports
from pyspark import SparkConf, SparkContext
## Module Constants
APP_NAME = "My Spark Application"
## Closure Functions
## Main functionality
def main(sc):
pass
if __name__ == "__main__":
# Configure Spark
conf = SparkConf().setAppName(APP_NAME)
conf = conf.setMaster("local[*]")
sc = SparkContext(conf=conf)
# Execute Main functionality
main(sc)
这个模板列出了一个Spark应用所需的东西：导入Python库，模块常量，用于调试和Spark UI的可识别的应用名称，还有作为驱动程序运行的一些主要分析方法学。在ifmain中，我们创建了SparkContext，使用了配置好的context执行main。我们可以简单地导入驱动代码到pyspark而不用执行。注意这里Spark配置通过setMaster方法被硬编码到SparkConf，一般你应该允许这个值通过命令行来设置，所以你能看到这行做了占位符注释。 使用<sc.stop()或<sys.exit(0)来关闭或退出程序。
import csv
import matplotlib.pyplot as plt
from StringIO import StringIO
from datetime import datetime
from collections import namedtuple
from operator import add, itemgetter
from pyspark import SparkConf, SparkContext
APP_NAME = "Flight Delay Analysis"
DATE_FMT = "%Y-%m-%d"
TIME_FMT = "%H%M"
fields = ('date', 'airline', 'flightnum', 'origin', 'dest', 'dep',
'dep_delay', 'arv', 'arv_delay', 'airtime', 'distance')
Flight = namedtuple('Flight', fields)
def parse(row):
"""
Parses a row and returns a named tuple.
"""
row[0] = datetime.strptime(row[0], DATE_FMT).date()
row[5] = datetime.strptime(row[5], TIME_FMT).time()
row[6] = float(row[6])
row[7] = datetime.strptime(row[7], TIME_FMT).time()
row[8] = float(row[8])
row[9] = float(row[9])
row[10] = float(row[10])
return Flight(*row[:11])
def split(line):
"""
Operator function for splitting a line with csv module
"""
reader = csv.reader(StringIO(line))
return reader.next()
def plot(delays):
"""
Show a bar chart of the total delay per airline
"""
airlines = [d[0] for d in delays]
minutes = [d[1] for d in delays]
index = list(xrange(len(airlines)))
fig, axe = plt.subplots()
bars = axe.barh(index, minutes)
for idx, air, min in zip(index, airlines, minutes):
if min > 0:
bars[idx].set_color('#d9230f')
axe.annotate(" %0.0f min" % min, xy=(min+1, idx+0.5), va='center')
else:
bars[idx].set_color('#469408')
axe.annotate(" %0.0f min" % min, xy=(10, idx+0.5), va='center')
ticks = plt.yticks([idx+ 0.5 for idx in index], airlines)
xt = plt.xticks()[0]
plt.xticks(xt, [' '] * len(xt))
plt.grid(axis = 'x', color ='white', linestyle='-')
plt.title('Total Minutes Delayed per Airline')
plt.show()
def main(sc):
airlines = dict(sc.textFile("ontime/airlines.csv").map(split).collect())
airline_lookup = sc.broadcast(airlines)
flights = sc.textFile("ontime/flights.csv").map(split).map(parse)
delays = flights.map(lambda f: (airline_lookup.value[f.airline],
add(f.dep_delay, f.arv_delay)))
delays = delays.reduceByKey(add).collect()
delays = sorted(delays, key=itemgetter(1))
for d in delays:
print "%0.0f minutes delayed\t%s" % (d[1], d[0])
plot(delays)
if __name__ == "__main__":
conf = SparkConf().setMaster("local[*]")
conf = conf.setAppName(APP_NAME)
sc = SparkContext(conf=conf)
main(sc)
使用<spark-submit命令来运行这段代码（假设你已有ontime目录，目录中有两个CSV文件）： 这个Spark作业使用本机作为master，并搜索app.py同目录下的ontime目录下的2个CSV文件。最终结果显示，4月的总延误时间（单位分钟），既有早点的（如果你从美国大陆飞往夏威夷或者阿拉斯加），但对大部分大型航空公司都是延误的。注意，我们在app.py中使用matplotlib直接将结果可视化出来了： 这段代码做了什么呢？我们特别注意下与Spark最直接相关的main函数。首先，我们加载CSV文件到RDD，然后把split函数映射给它。split函数使用csv模块解析文本的每一行，并返回代表每行的元组。最后，我们将collect动作传给RDD，这个动作把数据以Python列表的形式从RDD传回驱动程序。本例中，airlines.csv是个小型的跳转表（jump table），可以将航空公司代码与全名对应起来。我们将转移表存储为Python字典，然后使用sc.broadcast广播给集群上的每个节点。 接着，main函数加载了数据量更大的flights.csv（[译者注]作者笔误写成fights.csv，此处更正）。拆分CSV行完成之后，我们将parse函数映射给CSV行，此函数会把日期和时间转成Python的日期和时间，并对浮点数进行合适的类型转换。每行作为一个NamedTuple保存，名为Flight，以便高效简便地使用。 有了Flight对象的RDD，我们映射一个匿名函数，这个函数将RDD转换为一些列的键值对，其中键是航空公司的名字，值是到达和出发的延误时间总和。使用reduceByKey动作和add操作符可以得到每个航空公司的延误时间总和，然后RDD被传递给驱动程序（数据中航空公司的数目相对较少）。最终延误时间按照升序排列，输出打印到了控制台，并且使用matplotlib进行了可视化。 这个例子稍长，但是希望能演示出集群和驱动程序之间的相互作用（发送数据进行分析，结果取回给驱动程序），以及Python代码在Spark应用中的角色。 结论尽管算不上一个完整的Spark入门，我们希望你能更好地了解Spark是什么，如何使用进行快速、内存分布式计算。至少，你应该能将Spark运行起来，并开始在本机或Amazon EC2上探索数据。你应该可以配置好iPython notebook来运行Spark。 Spark不能解决分布式存储问题（通常Spark从HDFS中获取数据），但是它为分布式计算提供了丰富的函数式编程API。这个框架建立在伸缩分布式数据集（RDD）之上。RDD是种编程抽象，代表被分区的对象集合，允许进行分布式操作。RDD有容错能力（可伸缩的部分），更重要的时，可以存储到节点上的worker内存里进行立即重用。内存存储提供了快速和简单表示的迭代算法，以及实时交互分析。 由于Spark库提供了Python、Scale、Java编写的API，以及内建的机器学习、流数据、图算法、类SQL查询等模块；Spark迅速成为当今最重要的分布式计算框架之一。与YARN结合，Spark提供了增量，而不是替代已存在的Hadoop集群，它将成为未来大数据重要的一部分，为数据科学探索铺设了一条康庄大道。
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