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R语言中的并行处理

原作者: [db:作者] 来自: [db:来源] 收藏 邀请

网上有人说foreach包可以并行,我就去弄了,结果发现一个普通的二重循环什么事都不错都很卡!捣鼓了半天才发现是foreach的问题

 

为了提速,做了如下事宜:

  • 直接利用矩阵列加减,不是一个个遍历加
  • 把loop里面的函数调用去掉(开销很大)
  • 不使用foreach,使用原始的for
#计算trustl
R.trust_matrix <- matrix(rep(0,R.item_count*R.user_count),nrow=R.user_count, ncol=R.item_count);

to_add = matrix(rep(1,R.user_count),nrow=R.user_count,ncol=1)
for(i in 1:R.user_count) {
  for(j in 1:R.item_count) {
    if(abs( R.init_matrix[i,j] - R.init_predict_matrix[i,j] < error_threshold)){
      R.trust_matrix[,j] <- R.trust_matrix[,j] + to_add
      R.trust_matrix[i,j] <- R.trust_matrix[i,j] - 1
    }
  }
  print(i)
}

  这里记录了利用多核计算的一些包,有时间再琢磨:

http://cran.r-project.org/web/views/HighPerformanceComputing.html

这里有一个foreach的用法

http://cran.r-project.org/web/packages/foreach/vignettes/foreach.pdf

 


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