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R语言︱数据库SQL-R连接与SQL语句执行(RODBC、sqldf包)

原作者: [db:作者] 来自: [db:来源] 收藏 邀请

数据库是极其重要的R语言数据导入源数据之地,读入包有sqldf、RODBC等。跟SQL server相连有RODBC,跟mySQL链接的有RMySQL。但是在R里面,回传文本会出现截断的情况,这一情况可把我弄得有点手足无措。



一、数据库读入——RODBC包

CRAN 里面的包 RODBC 提供了 ODBC的访问接口:

    odbcConnect 或 odbcDriverConnect (在Windows图形化界面下,可以通过对话框选择数据库) 可以打开一个连接,返回一个用于随后数据库访问的控制(handle)。 打印一个连接会给出ODBC连接的一些细节,而调用 odbcGetInfo 会给出客户端和服务器的一些细节信息。
    在一个连接中的表的细节信息可以通过函数 sqlTables 获得。
    函数 sqlSave 会把 R 数据框复制到一个数据库的表中, 而函数 sqlFetch 会把一个数据库中的表拷贝到 一个 R 的数据框中。
    通过sqlQuery进行查询,返回的结果是 R 的数据框。(sqlCopy把一个 查询传给数据库,返回结果在数据库中以表的方式保存。) 一种比较好的控制方式是首先调用 odbcQuery, 然后 用 sqlGetResults 取得结果。后者可用于一个循环中 每次获得有限行,就如函数 sqlFetchMore 的功能。
    连接可以通过调用函数 close 或 odbcClose 来关闭。 没有 R 对象对应或不在 R 会话后面的连接也可以调用这两个函数来关闭, 但会有警告信息。

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    #安装RODBC包  
    install.packages("RODBC")   
    library(RODBC)  
    mycon<-odbcConnect("mydsn",u>


其中,sqldf 中的右连接、全连接已经失效,一般情况下会大多选择左联结。


(1)内连接——匹配到完全一致的


    > inner1<- merge(table1, table2, by = "id", all = F);inner1  #筛选相同id,F为只连接匹配到的,T为没有匹配到的赋值NA
      id a b
    1  3 c e
    > inner2<-inner_join(table1, table2, by = "id");inner2   #与merge完全一致
      id a b
    1  3 c e
    > inner3<-sqldf("select * from table1 as a inner join table2 as b on a.id=b.id");inner3 #内连接
      id a id b
    1  3 c  3 e
    > inner4<-sqldf("select * from table1 as a,table2 as b where a.id=b.id");inner4  #笛卡尔积
      id a id b
    1  3 c  3 e


匹配到完全一致、相同的,基础包merge=dplyr的inner_join=sqldf包中的inner join。当然输出结果中,sqldf中会蹦出来两个id,可以进行删除。

其中sql包中的Inner join语法结构为:

select * from 数据集1 as a      inner join   数据集2  as b on a.指标名称=b.指标名称


(2)左连接——最有效,以数据集1为准,匹配到的+为匹配到的


    > left1<- merge(table1, table2, by = "id", all.x = TRUE);left1  #按照id连接所有信息包括进去
      id a    b
    1  1 a <NA>
    2  2 b <NA>
    3  3 c    e
    > left2<-left_join(table1, table2, by = "id");left2
      id a    b
    1  1 a <NA>
    2  2 b <NA>
    3  3 c    e
    > left3<-sqldf("select * from table1 as a left join table2 as b on a.id=b.id");left3
      id a id    b
    1  1 a NA <NA>
    2  2 b NA <NA>
    3  3 c  3    e


基础包中的merge,当all=F就是内连接,all=T就是全连接,all.x=T就是左联结,all.y=T就是右连接(merge函数首选all=T,全连接);dplyr中的left_join也可以实现merge,all=T效果

sqldf中的语法结构:

select * from 数据集1 as a left join 数据集2as b on a.指标名称=b.指标名称


4、数据去重


    #删除重复的行*/
    sqldf("select DISTINCT  year from sale")

解读:distinct跟unique去重功能差不多,语法特点:

select DISTINCT 指标名称 from 数据集

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应用一:R语言中文本回传SQL出现截断(truncated )现象,怎么办?


      R语言中用sqlSave函数,把文本回传的时候回出现这样的问题,文本超过255个字符的会出现截断truncated现象,因为回传到SQL之后,规定的字符数即为varchar(255),所以会出现截断现象。

      如果出现这样的截断现象该如何解决呢?


      解决办法一:修改SQL Server的字符

      先创建一个表,然后把那个字符型格式修改为varchar(4000),或者其他格式,不能修改成max,会报错,造成Rstudio崩溃。当然,也可以先sqlSave一个版本过去(就几条内容),然后修改一下格式之后,继续append追加内容进行。

      SQL Server 2008中在修改数据类型的时候,会报错,一直保存不了,需要按照以下的内容设置一下:

选择菜单 工具-〉选项-〉表设计器(Designers)-〉表设计器和数据库设计器table and database designers。然后去掉“ 阻止保存要求重新创建表的更改”(prevent saving changes that require table re-creation)前面的勾。重新启动MSSQL SERVER 2008可以解决该问题。 (来源博客:http://franciswmf.iteye.com/blog/1962550)


      但是笔者在尝试该办法的时候,总是修改之后就卡死,所以无奈选择第二条路。


      解决办法二:从R中导出然后导入SQL Server

      笔者尝试过,导出csv/txt但是直接用SQL Server内嵌工具,“SQL Server Import and export Wizard”对于csv/txt导入都十分麻烦,导入出现很多问题。

      所以最后是用csv-转excel-用上述工具导入。


      问题一:R语言中,用write.csv时候,用office打开,多出了很多行?

      如果文本字符长度很大,那么就会出现内容串到下面一行的情况,譬如10行的内容,可能变成了15行。好像office默认单个单元格的字符一般不超过2500字符,超过就会给到下一行。

      所以笔者在导入5W条数据时候,多出了很多行,于是只能手动删除。

      如果用txt格式导出,用Notepad++打开是好的,但是用excel打开又多出来不少行,所以用excel打开是用代价的。

      但是由于excel是最好的导入SQL的格式,于是不得不手工删除,同时牺牲一部分的内容。


      问题二:如何使用SQL Server Import and export Wizard?

      1、choose a Data Source界面(注意勾选,在第一个数据行中显示列名称)

      2、Data Source中,有Flat File Source 栏目,就是用来做csv、txt格式的;还有一个excel选项是专门针对excel

      3、导入数据界面,你需要输入服务器名称,已经相应的数据库名称;

      4、选择源表和源视图,你可以通过”目标“栏目新建,也可以导入已经有的表格,当然第一次导入,笔者推荐直接导入新表,注意看检查一下下面的一个栏目”编辑映射“

      5、运行语句。

      其中,如果你是第二次导入已经有的表,那么在第四步,”编辑映射“时,就需要看清楚是否与已有的数据列表一一对应。

      同时,如果第二次导入的表有表头名称,只要第一步勾选列名称,也是没有关系的,导入后不算入数据之中。


主要教程来源于:http://www.xlgps.com/article/61446.html


      问题三:通过SQL代码导入

      相关内容可参考博客:

http://www.it165.net/database/html/201310/4632.html

http://www.cnblogs.com/wangshenhe/archive/2013/04/27/3047092.html


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贴张dplyr包的用法

 

 



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作者:悟乙己
来源:CSDN
原文:https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/51601539
版权声明:本文为博主原创文章,转载请附上博文链接!


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