环境准备

1 机器上有Eclipse 3.1和Matlab 2007a

2 机器的环境变量设置 
（1）JAVA_HOME (JDK的安装位置，如C:\Program Files\Java\jdk1.5.0) 

• 设置后，重启matlab才能有效。
• 用getenv JAVA_HOME在Matlab的命令窗口中试验，看看得到的返回值正确方可说明其对Matlab生效了。

（2）Classpath

• 添加matlabInstallRoot \toolbox\javabuilder\jar\javabuilder.jar

（3）Path

• 添加%JAVA_HOME%/bin/javac

将matlab的m文件生成为jar

1 在matlab的command窗口输入deploytool，会在右侧弹出一个新窗口（Deployment Tool）。

2 在Deployment Tool中，点击new按钮，选择Matlab Builder for Java与Java Package。新建一个工程名字，如flying.prj 。

3 确保在Deployment Tool面板中的Generate Verbose Output被勾上了。

4 将欲被java调用的m文件（如mydraw.m，其中包括两个参数(x,y)）从Matlab整个界面的左侧工作目录面板，拖拽到Deployment Tool中的新建的类下面的class 文件夹下。

5 点击build按钮，则会在matlab的当前目录下，生成以一个与工程同名的文件夹。如果build成功，会看到文件夹结构如下： 
Flying -----|----distrib 
                | |-----flying.jar 
                | |-----flying.ctf 
                | 
                |-------src 
                | |----flying 
                | |----flyingclass.java 
                | |----flyingMCR.java 
                | |----classes 
                | |----flying 
                | |----flyingclass.class 
                | |---- flyingMCR.class 
                |-------build.log 
                |-------flying.ctf 
                |-------flying.jar 
                |-------mccExcludedFiles.log 
                |-------readme.txt

编写java方法，准备调用刚刚生成好的flying.jar中的Matlab函数

1 在java工程属性的BuildPath中添加两个jar包：

• matlabroot\toolbox\javabuilder\jar\javabuilder.jar
• TestDirectory\flying.jar

2 编写函数示例如下

3 如果不能正常运行，可以考虑在 classpath 中，加入 flying.jar 所在的位置。

3 如果不能正常运行，可以考虑在 classpath 中，加入 flying.jar 所在的位置。 

详细

1 参见 matlab 的帮助文件

2 www.simwe.com/forum/archiver/tid-747229.html

3 数据类型相关

Java 的数值型数组，可以直接作为输入参数传递到 .m 文件上。

如：mydraw(x,y) ，可以画x=[1 2 3 4] ,y=[3.3 -5 6 10.2]这样的线图。Java调用该方法时候，如果传递的参数是整型或者实数型数组，则直接可成功。如java中：

注意：a,b 最好所有有索引的位置都有值，否则如果没有充分赋值曲线可能会最终折回(0,0)点。 

Matlab程序(.m文件)的修改

1 找到TestDirectory\flying.jar所在的位置（因为按照上述步骤的话，.m源文件就在该位置附近）。这个位置，从Eclipse的Package Explore可以用看到。

2 直接修改欲改动的.m文件 

3 打开Matlab, 在Command输入Deploytool, 在新打开的部署面板中，“打开”该m文件所在的工程，如flying.prj。 

4 选中相应工程下Class 文件夹下的.m文件，点击工具栏的Build按钮。 

5 则相应源文件被重新编译。如果按照前面步骤添加的jar包，则编译后新生成的jar包自动替换掉原有的jar。又由于这个jar的位置已经作为BuildPath告诉了java的相应工程，因此Java端不需要做任何调整即可正确调用到新修改了内容的matlab方法。

[转] http://www.cnblogs.com/allanyz/archive/2009/05/04/1449081.html

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[另] Matlab自带的Example： MATLABroot\R2008a\toolbox\javabuilder\Examples\MatrixMathExample\ 等

       Java调用Matlab作图example： http://blog.csdn.net/xiaowei_cqu/article/details/7038819