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merge函数:R语言,根据相同的列或ID合并不同的文件

原作者: [db:作者] 来自: [db:来源] 收藏 邀请

一般Excel就能实现根据相同的列或ID合并不同的文件,但对于大文件来说,比如几十个G的数据量,用Excel处理,不仅耗时,而且还会使电脑崩溃。R语言的优势就体现在这里了,处理大文件相当快。

first<-read.table('/pheno/first.txt',header=T)
first<-data.frame(first)
rs123456761<-read.table("/SNP/rs123456761.ped",header=T)
rs123456761<-data.frame(rs123456761)
merge_rs123456761<-merge(rs123456761,first,by.x='ID',by.y='ID')#假设根据相同的ID合并rs123456761和first两个文件
write.table(merge_rs123456761,'/SNP/merge_rs123456761.csv', quote = F,sep=" ")

注意:使用merge函数合并文件时,要把文件转化为数据框格式(data.frame)


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