R语言系列：生成数据 (2014-05-0417:41:57)转载▼标签： r语言 教育分类： 生物信息生成规则数据1、使用“:“，如x=1:10，注意该方法既可以递增也可以递减，如y=10:12、seq，有两种用法：①seq(起点，终点，步长 ...……

最近准备写一篇关于自组织映射(Self-organizingmap)的文章。SOM的代码很多，研究了一圈之后目前使用最顺手的是R语言的kohonen包。这个kohonen包功能很丰富，但是接口不是特别合理。R语言包大部分是统计学家写的，功 ...……

解决的问题：需要读取某个大文件夹下所有子文件夹中的excel文件，并汇总，汇总文件中需要包含的2部分的信息：1.该条数据来源于哪个子文件夹；2.该条数据来源于哪个excel文件。最终，按照子文件夹单独保存汇总文件， ...……

主要学习如何把几种常用的数据格式导入到R中进行处理，并简单介绍如何把R中的数据保存为R数据格式和csv文件。 1、保存和加载R的数据(与R.data的交互：save()函数和load()函数) a amp; ...……

使用Anaconda3，目前已经有了python环境，安装rpy2后可在notebook中自由切换python与R语言，具体步骤如下：1，安装rpy2pipinstallrpy22，添加环境变量R_HOME：R软件主目录R_USER：C:/Users/Administrator（默认用户 ...……

R语言中的线性判别分析_r语言线性判别分析在R语言中，线性判别分析（LinerDiscriminantAnalysis，简称LDA），依靠软件包MASS中有线性判别函数lqa()来实现。该函数有三种调用格式：1）当对象为数据框data.frame时lda( ...……

RStudio是较早的跨平台的R语言开发IDE，其包含开源版和商业版，这两个版本对大多数的桌面系统都有很好的支持；在Linux的系统上，RStudio还支持搭建基于网络的RStudioServer或者RStudioServerPro。RStudio具有如下特 ...……

原文链接：http://www.biostatistic.net/thread-5065-1-1.htmlR语言在画图形的时候，经常遇到颜色设定问题，用户可以根据color、rgb值和hsv值来设定不同的颜色。第一列是颜色，第二列是hsv，第三列是rgbamp;amp;lt;i ...……

R语言-数据预处理一、日期时间、字符串的处理日期Date:日期类，年与日POSIXct:日期时间类，精确到秒，用数字表示POSIXlt:日期时间类，精确到秒，用列表表示Sys.date(),date(),difftime(),ISOdate(),ISOdatetime()#得 ...……

 原文链接：http://tecdat.cn/?p=6895 在开展基于概率推理的课程时，关键主题之一是基于似然函数的检验和置信区间构建。通常包括Wald，似然比和分数检验。在这篇文章中，我将修改Wald和似然比检验的优缺点。我将重 ...……

前提：我使用的anaconda步骤：创建新的R环境conda.batcreate-nrr-essentials（现在3版本不能直接使用conda命令）激活环境activater更新jupyter-core（截止2020-7-9，否则下面一步进行不了）pipinstalljupyter-core== ...……

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拔靴法属于重复抽样(resampling)方法，与MonteCarlo相比，二者真实的母体不同。它是将已有的观察值作为母体重复抽样，以求取原先资料不足二无法探讨的资料特性。举个例子，假设x1,x2,...,xn为来自同一分配的观察值， ...……

数据文件Rscript##批量读取数据fileamp;amp;lt;-list.files(pattern=amp;quot;mating.index.dataamp;quot;)##循环处理merge.dataamp;amp;lt;-list()n=length(file)for(fin1:n){hal.treeamp;amp;lt;-read.tree(amp;qu ...……

library(data.table)library(org.Hs.eg.db)library(clusterProfiler)setwd(amp;quot;exampleamp;quot;)dtamp;amp;lt;-read.table(amp;quot;VanAllen.self_subtractamp;quot;,sep=amp;quot;\tamp;quot;,header=T)dt$g ...……

 符号用途~分隔符号，左边为响应变量，右边为解释变量，eg：要通过x、z和w预测y，代码为y~x+z+w+分隔预测变量:表示预测变量的交互项eg：要通过x、z及x与z的交互项预测y，代码为y~x+z+x:z*表示所有可能交互项的简洁 ...……

args_test.R代码如下：Argsamp;amp;lt;-commandArgs()cat(amp;quot;Args=amp;quot;,Args,amp;quot;\namp;quot;)cat(amp;quot;Args=amp;quot;,Args,amp;quot;\namp;quot;)cat(amp;quot;Args=amp;quot;,Args,amp;quot; ...……

1Python-joypy制作峰峦图到网址：https://github.com/sbebo/joypy  可下载zipJoyPy是一个基于matplotlib+pandas的单功能Python软件包，其目的仅在于：绘制Joyplots（又称脊线图）。 下载JoyPy包pipinstalljoypy# ...……

当我们想要把数据框的行或者列按照指定的顺序排列时，可以通过行名称或者列名称快速排列dataamp;amp;lt;-data.frame(matrix(1:9,ncol=3))rownames(data)amp;amp;lt;-c(amp;quot;C1amp;quot;,amp;quot;C2amp;quot;,am ...……

eval()’sfirstargumentisanexpression.Soifyouonlyprovideoneargument,itwillevaluatetheexpressioninthecurrentenvironment.假设环境中存在变量x=10eval(quote(x),list(x=30))相当于首先,quote(x)……

参考自【数据挖掘与R语言】rpart包可实现回归树。通常分为两步建立回归树：1.生成一棵较大的树 2.通过统计估计删除一些结点来对树进行修剪。回归树基础实现library(rpart)rpart(y~.,data=data1) 参数形式与lm()函 ...……

原文链接：http://tecdat.cn/?p=6481 总结数据集##Skimsummarystatistics##nobs:150##nvariables:5####Variabletype:factor##variablemissingcompletenn_uniqueto……

Sample函数用法：sample(x,size,replace=FALSE,prob=NULL)Arguments x-可以是含有一个或多个元素的向量或只是一个正整数。x的长度为1时，那么便从1：x中抽取样本。size- 非负整数，从总体抽取样本的个数replace-是 ...……

Question:1.R语言与C语言语法上有什么不同，有什么相同？所有R代码都用于操作对象，和C++一样是面向对象的语言，C是面向过程的语言，R中有每一种数据结构相当于C++中的类，每个数据相当于一个对象；有数值向量形式的 ...……

包含Fisher判别的简单介绍及使用R语言实现Fisher判别，最后给出一个例子……

在R中获得快速运行代码的方法使用向量化运算R语言的并行计算可以用parallel和foreach包加快R运行速度还可以使用cmpfun（）函数即字节码编译器再者就是在R中调用C或C++同时还可以利用Rprof()来寻找代码的瓶颈利用分块 ...……

不放回采样：sample(1:10,5,replace=FALSE)生成组合：……

不同的行业对于数据集的行和列叫法不同。统计学家称它们为观测（observation）和变量（variable），数据库分析师则称其为记录（record）和字段（field），数据挖掘和机器学习学科的研究者则把它们叫作示例（example ...……

第二章 创建数据集 1.R语言的数据类型 数值型、字符型、逻辑型、复数型（虚数）和原生型（字节） 2.数据结构 a.向量：存储数值型、字符型和逻辑型数据的一维数组 amp;gt;amp;#160;a=c(1,2, ...……

1. 数据科学家需要具备的知识和技能 - Drew Conway: http://drewconway.com/the-lab/（substantive expertise：实质性的知识） - Oamp;#……

  博客总目录：http://www.cnblogs.com/weibaar/p/4507801.html    ---- 前言: 应用背景兼吐槽 继续延续之前每个月至少一次更新博客，归纳总结学习心得好习惯。 这次的主题是论R与excel的结合，又称 论如何正 ...……

R中的变量可以存储任何数据类型，也可以存放任何R对象，例如函数、分析的结果以及一个图形。单个变量在某时刻取值为一个数字，而后可以被赋值为字符，再而后又可以被赋值为一个数字。对一个变量进行赋值有许多方式 ...……

R语言数据分析前期：预处理过程，供自己查阅，欢迎大家指正。 利用R语言导入数据： taobaoamp;lt;-read.csv(amp;quot;taobao.csvamp;quot;,stringsAsFactors……

本砖假在安装R语言和RStdio遇到了一些问题，分享大家一下，不当之处可以下方留言~~~^^1.R语言的下载安装我是从班级群里面直接下载的R-4.0.0-win和RStudio-1.2.5042 ...……

一、独立性检验 根据频数信息判断两类因子彼此相关或相互独立的假设检验。 p value p value就是Probability的值,它是一个通过计算得到的概率值,也就是在原假设为真时, 得到最大的或 ...……

数据分析R语言无意中发现网上的一个数据分析R应用教程，看了几集感觉还不错，本文做一个学习笔记(知识点来源：视频内容+R实战+自己的理解)，视频详细的信息请参考http://www.itao521.co ...……

转载：http://blog.csdn.net/duqi_yc/article/details/9817243 目录 Table of Contents 1 正则表达式简介 2 字符数统计和字符翻译……

一、实验说明 1. 环境登录 无需密码自动登录，系统用户名shiyanlou，密码shiyanlou 2. 环境介绍 本实验环境采用带桌面的Ubuntu Linux环境，实验中会用到程序： 1. LX终端（LXTerminal）: Linux命令行终端，打开后会 ...……

什么是DataFrame引用 r-tutor上的定义：DataFrame是一个表格或者类似二维数组的结构，它的各行表示一个实例，各列表示一个变量。没错，DataFrame就是类似于Excel表格和MySQL数据库一样是一个结构化的数据体。而这种 ...……

生成规则数据1、使用“:“，如x=1:10，注意该方法既可以递增也可以递减，如y=10:12、seq，有两种用法：①seq(起点，终点，步长);②seq(length=9,from=1,to=5)    seq还有一种简写：seq(x)    #相当于1:lengt ...……